Součástí doktorského studia je absolvování vybraných předmětů a jejich zakončení zkouškou. Konkrétní předměty a termíny stanovuje individuální plán studenta, který musí schválit jeho školitel.
Na Fakultě strojního inženýrství se doktorské studium uskutečňuje v těchto oborech:
| Program: D4T-P Strojírenská technologie - doktorský | ||||
| Obor (zkratka, název) | Specializace | Stupeň | Ročník | |
| D-STG Strojírenská technologie | - | |||
| Program: D4A-P Aplikované vědy v inženýrství - doktorský | ||||
| Obor (zkratka, název) | Specializace | Stupeň | Ročník | |
| D-IME Inženýrská mechanika | - | |||
| Program: D4Z-P Stroje a zařízení - doktorský | ||||
| Obor (zkratka, název) | Specializace | Stupeň | Ročník | |
| D-KPI Konstrukční a procesní inženýrství | Energetické inženýrství | - | ||
| D-KPI Konstrukční a procesní inženýrství | Fluidní inženýrství | - | ||
| D-KPI Konstrukční a procesní inženýrství | Procesní inženýrství | - | ||
| D-KPI Konstrukční a procesní inženýrství | Stroje a zařízení | - | ||
| D-KPI Konstrukční a procesní inženýrství | Konstrukční inženýrství | - | ||
| D-KPI Konstrukční a procesní inženýrství | Automobilní a dopravní inženýrství | - | ||
| D-KPI Konstrukční a procesní inženýrství | Stavba letadel a provoz letadel | - | ||
| D-KPI Konstrukční a procesní inženýrství | Technika prostředí | - | ||
| D-KPI Konstrukční a procesní inženýrství | Řízení strojů a procesů | - | ||
| Program: D4P-P Aplikace přírodních věd - doktorský | ||||
| Obor (zkratka, název) | Specializace | Stupeň | Ročník | |
| D-APM Aplikovaná matematika | - | |||
| Program: D4F-P Fyzikální a materiálové inženýrství - doktorský | ||||
| Obor (zkratka, název) | Specializace | Stupeň | Ročník | |
| D-FMI Fyzikální a materiálové inženýrství | Fyzikální inženýrství | - | ||
| D-FMI Fyzikální a materiálové inženýrství | Materiálové inženýrství | - | ||


